Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms