Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms