Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMKK2Q96RR4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms