Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms