Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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UBE2E2Q96LR5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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UBE2E2Q96LR5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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UBE2E2Q96LR5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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UBE2E2Q96LR5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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UBE2E2Q96LR5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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