Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SENP8Q96LD8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms