Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CNRIP1Q96F85 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CNRIP1Q96F85 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms