Protein–RNA interactions for Protein: Q96CU9

FOXRED1, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXRED1Q96CU9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXRED1Q96CU9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms