Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHF3Q92576 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms