Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms