Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC148Q8NFR7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms