Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPTSSBQ8NFR3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms