Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms