Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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FAM71DQ8N9W8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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FAM71DQ8N9W8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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FAM71DQ8N9W8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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FAM71DQ8N9W8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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FAM71DQ8N9W8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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FAM71DQ8N9W8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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FAM71DQ8N9W8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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FAM71DQ8N9W8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM71DQ8N9W8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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