Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms