Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms