Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms