Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms