Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FAM78BQ5VT40 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM78BQ5VT40 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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