Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCAF6Q58WW2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms