Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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