Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms