Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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