Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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RTL8BQ17RB0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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RTL8BQ17RB0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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RTL8BQ17RB0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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RTL8BQ17RB0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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RTL8BQ17RB0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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