Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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HIF1AQ16665 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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HIF1AQ16665 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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