Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SNAPC1Q16533 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SNAPC1Q16533 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SNAPC1Q16533 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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