Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDB1Q16531 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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