Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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