Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms