Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB39AQ14964 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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RAB39AQ14964 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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