Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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