Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERV3-1Q14264 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERV3-1Q14264 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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