Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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ITGA9Q13797 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGA9Q13797 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGA9Q13797 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGA9Q13797 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGA9Q13797 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGA9Q13797 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGA9Q13797 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGA9Q13797 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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ITGA9Q13797 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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ITGA9Q13797 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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