Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
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