Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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