Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms