Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXE3Q13461 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXE3Q13461 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXE3Q13461 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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