Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms