Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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