Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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ITGB3BPQ13352 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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ITGB3BPQ13352 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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ITGB3BPQ13352 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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ITGB3BPQ13352 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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ITGB3BPQ13352 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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ITGB3BPQ13352 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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ITGB3BPQ13352 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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ITGB3BPQ13352 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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ITGB3BPQ13352 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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ITGB3BPQ13352 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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