Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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