Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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