Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAF1AQ13111 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms