Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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IFT88Q13099 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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IFT88Q13099 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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IFT88Q13099 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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IFT88Q13099 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT88Q13099 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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