Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF1Q13077 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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