Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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