Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIM32Q13049 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM32Q13049 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms