Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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