Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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