Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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